Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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