Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx29Q9D3S3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms