Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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