Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2cQ9D1C1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms