Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RpainQ9CWY9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpainQ9CWY9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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