Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4930519P11RikQ9CUJ8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms