Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lhfpl3Q9CTN8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms