Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ykt6Q9CQW1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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