Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms