Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdm1Q9CQK3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdm1Q9CQK3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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