Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQF4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQF4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQF4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9CQF4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQF4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms