Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rpa3Q9CQ71 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rpa3Q9CQ71 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rpa3Q9CQ71 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rpa3Q9CQ71 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rpa3Q9CQ71 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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