Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Use1Q9CQ56 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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