Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Smim3Q99PE5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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