Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd1Q99MV1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd1Q99MV1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms