Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ciao1Q99KN2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms