Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ubxn2aQ99KJ0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms