Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms