Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb6Q922F4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms