Protein–RNA interactions for Protein: Q91XS1

Mtmr4, Myotubularin-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr4Q91XS1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr4Q91XS1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms