Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd3Q91W18 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd3Q91W18 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms