Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms