Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam20bQ8VCS3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms