Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms