Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim68Q8K243 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim68Q8K243 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trim68Q8K243 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trim68Q8K243 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trim68Q8K243 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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