Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp27Q8CEG8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp27Q8CEG8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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