Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx30Q8CE50 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms