Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slfn5Q8CBA2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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