Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms