Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrp4bQ8C6J9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms