Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Atg16l1Q8C0J2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Atg16l1Q8C0J2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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