Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc30Q8BVF4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc30Q8BVF4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms