Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp1Q8BJQ2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp1Q8BJQ2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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