Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd6Q8BGE4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd6Q8BGE4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms