Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htatsf1Q8BGC0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms