Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Srrm3Q80WV7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srrm3Q80WV7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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