Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Avl9Q80U56 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms