Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo1Q7TT28 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo1Q7TT28 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms