Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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