Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actn1Q7TPR4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms