Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nme8Q715T0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms