Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Timd4Q6U7R4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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