Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6PD19 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6PD19 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6PD19 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6PD19 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6PD19 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6PD19 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6PD19 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6PD19 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6PD19 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6PD19 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6PD19 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms