Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttbk1Q6PCN3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms