Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp12Q6P5B0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rrp12Q6P5B0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms