Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnna3Q65CL1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms