Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Irf4Q64287 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms