Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ss18Q62280 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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