Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbm38Q62176 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rbm38Q62176 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm38Q62176 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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