Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga6Q61739 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga6Q61739 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms